Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms