Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip5Q8R361 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip5Q8R361 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms