Protein–RNA interactions for Protein: Q8K262

Plac9, Placenta-specific protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac9Q8K262 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac9Q8K262 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac9Q8K262 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac9Q8K262 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac9Q8K262 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac9Q8K262 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac9Q8K262 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac9Q8K262 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac9Q8K262 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac9Q8K262 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac9Q8K262 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms