Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne5Q8JZW4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne5Q8JZW4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms