Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nupl2Q8CIC2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms