Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp11Q8CFF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp11Q8CFF0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms