Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc27Q8CD92 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc27Q8CD92 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms