Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
6030452D12RikQ8CD33 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms