Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip1Q8C079 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip1Q8C079 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms