Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ctdsp2Q8BX07 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ctdsp2Q8BX07 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ctdsp2Q8BX07 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ctdsp2Q8BX07 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp2Q8BX07 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Ctdsp2Q8BX07 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms