Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjd4Q8BSD4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjd4Q8BSD4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjd4Q8BSD4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjd4Q8BSD4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjd4Q8BSD4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjd4Q8BSD4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjd4Q8BSD4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjd4Q8BSD4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjd4Q8BSD4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjd4Q8BSD4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms