Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Vipas39Q8BGQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Vipas39Q8BGQ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Vipas39Q8BGQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Vipas39Q8BGQ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Vipas39Q8BGQ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vipas39Q8BGQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Vipas39Q8BGQ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms