Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Necab1Q8BG18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Necab1Q8BG18 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms