Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc28Q80XJ3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms