Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms