Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lca5Q80ST9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms