Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp397Q7TNK4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp397Q7TNK4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms