Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcl2Q78Y63 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcl2Q78Y63 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms