Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eci3Q78JN3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eci3Q78JN3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms