Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SpopQ6ZWS8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms