Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M2Q6W9L1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms