Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINGO4Q6UY18 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms