Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrm2bQ6PEE3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrm2bQ6PEE3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms