Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atl2Q6PA06 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atl2Q6PA06 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms