Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrimpolQ6P1E7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms