Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc66Q6NS45 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc66Q6NS45 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms