Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw2Q6I6G8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hecw2Q6I6G8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms