Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf8Q6DID3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf8Q6DID3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms