Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms