Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Kdm5dQ62240 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Kdm5dQ62240 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms