Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna2Q61301 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna2Q61301 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna2Q61301 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna2Q61301 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna2Q61301 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna2Q61301 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna2Q61301 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna2Q61301 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms