Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms