Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf3Q60765 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atf3Q60765 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms