Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tcf4Q60722 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms