Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema5bQ60519 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms