Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncoa4Q5U4H9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncoa4Q5U4H9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa4Q5U4H9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms