Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scaf1Q5U4C3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms