Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NacadQ5SWP3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NacadQ5SWP3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms