Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPM1JQ5JR12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPM1JQ5JR12 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPM1JQ5JR12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPM1JQ5JR12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPM1JQ5JR12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPM1JQ5JR12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms