Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAVIN4Q5BKX8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms