Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf2Q59J78 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndufaf2Q59J78 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms