Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf608Q56A10 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf608Q56A10 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms