Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm44Q3V089 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbm44Q3V089 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms