Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr55Q3UJF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms