Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Greb1Q3UHK3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Greb1Q3UHK3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms