Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trip13Q3UA06 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms