Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KhsrpQ3U0V1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KhsrpQ3U0V1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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