Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Smarca4Q3TKT4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Smarca4Q3TKT4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms