Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms