Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
V1rd19Q3KNP5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms